Фамилия Кузишины — редкий случай, когда за вполне привычным звучанием кроется нестандартная словообразовательная модель. В отличие от большинства русских фамилий на -ин, которые образованы от имён или прозвищ на -а/-я (Кузьмин, Кузин), здесь мы видим суффикс -иш-ин. Эта двойная суффиксация — характерная черта западнорусских и украинских говоров, где сначала к основе добавляли увеличительный или уничижительный суффикс -иш(а), а уже потом фамильный -ин. Иными словами, Кузишин — это «чей?» — сын Кузиши.

Кузиша, в свою очередь, — не просто краткая форма, а скорее народно-бытовой вариант церковного имени Косма (в русском обиходе — Кузьма). Имя греческое, связанное со словом «космос» — мироздание, порядок. На Руси его носили часто, особенно в крестьянской и ремесленной среде, во многом благодаря почитанию святых Космы и Дамиана, покровителей врачевания и кузнечного дела. Поэтому Кузишей могли в быту называть не только человека по имени Кузьма, но и его сына, подмастерья или просто человека, связанного с кузницей.

Фамилия Кузишин закрепляет именно эту форму — через «у» и с характерным южнорусским или украинским «и» на месте ожидаемого «ы» (сравните: Кузишин, а не Кузышин). Географически такие фамилии чаще всего встречаются в западных областях России, а также среди украинских и белорусских родов, где суффикс -ишин так же распространён, как и -енко.

Версия о происхождении напрямую от канонического Косма — основная, но стоит упомянуть и менее вероятную: в некоторых говорах «кузиша» могло быть прозвищем от глагола «кузить» — докучать, приставать. Однако в случае с фамилией Кузишин эта гипотеза слабая, так как прозвищная модель с суффиксом -иша обычно образуется от имён, а не от глагольных основ.

Таким образом, фамилия Кузишины — живой след диалектной традиции именования, где имя Кузьма обросло сначала уменьшительно-ласкательным суффиксом, а затем патронимическим окончанием. Это не просто «сын Кузьмы», а «внук или потомок того, кого в семье звали Кузишей».