Фамилия Кузоваткин образована от прозвища Кузоватка. В его основе лежит прилагательное «кузоватый», то есть «похожий на кузов». Так на Руси могли прозвать невысокого, полного человека — прозвище указывало на особенности внешности. Кузовом в старину называли не только короб для сена или грибов, но и неповоротливую, округлую фигуру. Прозвище Кузоватка закрепилось за человеком как обиходное именование, а со временем перешло в фамилию.

Модель образования типична для восточнославянских фамилий: суффикс -ин присоединялся к основе на -а, обозначая принадлежность: «чей сын?» — Кузоваткин, то есть сын Кузоватки. По той же схеме возникли фамилии Козловкин, Барабашкин. Фамилия редкая, её распространение тяготеет к центральным и северным регионам России — там, где диалектное слово «кузоватый» бытовало дольше. Встречаются и однокоренные варианты: Кузоватов, Кузовкин, но Кузоваткин стоит особняком из-за уменьшительно-пренебрежительного суффикса -к-, который в прозвище мог смягчать грубоватое описание внешности.