Фамилия Кырин — редкий случай, где географический корень почти наверняка перевешивает прозвищный. Разбирать её стоит не с суффикса (он стандартный, -ин, указывает на принадлежность «чей?» — сын Кыри), а с самой основы. В русских говорах и ономастиконе фамилия закреплена за Восточной Сибирью, прежде всего за Забайкальем.

Основа «Кыр-» почти наверняка топонимическая. В Забайкалье есть река Кыра и посёлок Кыра (районный центр в Забайкальском крае). По одной из версий, гидроним восходит к бурятскому или эвенкийскому слову со значением «каменистый», «щебнистый» — описание русла горной реки. Человек, которого прозвали Кыра, мог быть выходцем из этого села или живущим на той реке. Тогда Кырин — типичная «географическая» фамилия, как Москвин или Тверитин, только с местным сибирским колоритом.

Менее вероятна, но возможна версия от прозвища Кыра. В русских диалектах слово «кыра» (или «кыря») могло означать коротышку, низкорослого человека, а в некоторых говорах — задиру, неуживчивого человека. Однако в письменных источниках (например, в словаре древнерусских прозвищ С. Б. Веселовского) такое прозвище не фиксируется, в отличие от реально существующего села Кыра. Поэтому топонимическая версия выглядит убедительнее.

Модель образования проста: к основе «Кыр-» добавили притяжательный суффикс -ин. Фамилия закрепилась в форме прилагательного: «чей?» — Кырин, то есть «сын Кыры». В XVII–XIX веках, когда крестьяне и казаки осваивали Забайкалье, подобные фамилии от названий рек и поселений давали переселенцам, чтобы отличать их от однофамильцев из других мест.

Социально фамилия Кырин не была дворянской или купеческой. Скорее всего, её носили крестьяне-старожилы или казаки Забайкальского казачьего войска, которые веками жили в тех краях. Ударение в фамилии — на первый слог, Кы́рин, что тоже характерно для сибирских говоров.

Однокоренных фамилий в русском языке почти нет, поскольку корень диалектный и локальный. Исключение — фамилия Кыров, но она может быть образована от другого источника (например, от тюркского имени). Так что Кырин стоит особняком, и её носитель почти наверняка имеет корни в Восточной Сибири, в районе современного Забайкальского края.