Фамилия Кысленко, скорее всего, имеет прозвищное происхождение, но её основа неочевидна и допускает несколько трактовок. Первое, что бросается в глаза, — украинский суффикс -енко, который в XVI–XVII веках формировал фамилии по модели «сын такого-то» или «потомок такого-то». Вместе с тем корень «кысл-» в русском и украинском языках почти всегда связан с кислым вкусом или запахом. Поэтому самая прямая версия: прозвище Кислый (или Кыслый) дали человеку с кислым выражением лица, ворчливому, либо тому, кто любил или делал кислые продукты — квас, щи, соленья. От этого прозвища и пошла фамилия Кысленко.

Однако есть нюанс: написание через «ы» вместо привычного «и» — Кисленко. Это может указывать на диалектное произношение или на старую орфографию. В южнорусских и украинских говорах «ы» после твёрдых согласных иногда сохранялось дольше, чем в литературном языке. Такое написание встречается в документах XIX века, когда фамилии записывали на слух, не унифицируя. Поэтому Кысленко и Кисленко — варианты одной фамилии, искать их корни нужно в одном гнезде.

Менее очевидная, но возможная версия отсылает к тюркскому корню. В татарском и башкирском языках «кыс» означает «давить, жать», а «кысыл» — «сжатый, зажатый». Прозвище Кысыл могло означать «прижимистый» или «застенчивый». Такая этимология правдоподобна для фамилий, возникших в зоне русско-тюркского пограничья, но для фамилии на -енко это менее типично: суффикс -енко характерен для украинской антропонимии, где тюркские заимствования редки в качестве основ прозвищ.

География фамилии тоже подсказывает. Кысленко — фамилия редкая, встречается в основном на юге России, в Краснодарском крае, Ростовской области, а также в Украине. Это подтверждает её связь с украинской моделью образования. Носители фамилии, скорее всего, были крестьянами или казаками, поскольку прозвища такого типа (по внешности или характеру) были распространены именно в этих сословиях. Дворянских родов с фамилией Кысленко не зафиксировано.

В итоге: фамилия Кысленко образована от прозвища Кислый (Кыслый) с помощью патронимического суффикса -енко. Вариант написания с «ы» — не ошибка, а историческая или диалектная особенность записи. Предки носителя этой фамилии, скорее всего, жили на территории современной Украины или юга России и получили прозвище за кислый нрав или пристрастие к квашеной пище.