Фамилия Лабоднев — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, читается почти без изменений. В ней нет ни типичного для русских фамилий суффикса -ов/-ев, ни -ин. Основа «Лабоднев» — это бытовое прозвище, которое в XVI–XVII веках могли дать человеку, имевшему привычку или обязанность «лабать» (работать, делать что-либо) именно днём. Глагол «лабать» в северных и центральных русских говорах означал не только «играть на музыкальном инструменте» (это значение пришло позже из арго), а прежде всего «работать, трудиться, мастерить». Таким образом, Лабоднев — тот, кто «лабает днём», то есть работает в светлое время суток, в отличие от тех, кто трудился ночью (например, сторожей или мельников).

Словообразовательная модель фамилии архаична. Она образована напрямую от прозвища-словосочетания «Лабоднев» без добавления патронимического суффикса. В русской ономастике такие фамилии встречаются редко и обычно указывают на относительно позднее оформление (XVII–XVIII века), когда прозвище уже воспринималось как цельное имя. Есть вероятность, что первоначально прозвище звучало как «Лабоденный» (от «лабать денно»), но со временем упростилось до «Лабоднев» под влиянием более привычных окончаний на -ев.

Географически фамилия тяготеет к северо-западу России. По данным современных телефонных справочников и баз адресов, большинство носителей фамилии Лабоднев проживает в Псковской и Новгородской областях, а также в Санкт-Петербурге. Это косвенно подтверждает связь с новгородскими говорами, где слово «лабать» было особенно распространено. В южных и восточных регионах России фамилия почти не встречается.

В сословном отношении предки Лабодневых, скорее всего, были крестьянами или ремесленниками — людьми, чья работа была привязана к световому дню. Фамилия не несёт дворянского или духовного оттенка, её основа — чисто бытовая, описывающая распорядок труда. В отличие от фамилий, образованных от календарных имён (например, Лаврентьев), Лабоднев — прозвищная, и её значение прозрачно для носителя живого русского языка, знакомого с диалектной лексикой.