Фамилия Лагунцова — женская форма фамилии Лагунцов. Её основа — слово «лагун» или «лагунь», которое в русских говорах имело несколько значений. В большинстве случаев так называли деревянную кадку, бочонок для воды или кваса, а также небольшой сосуд для вина. Второе значение — ленивый, неповоротливый человек, «тюфяк». Третье, менее распространённое, — вид рыбы (бычок-подкаменщик). Какая из этих версий легла в основу прозвища Лагунец, сказать сложно: прозвища по ремеслу (бочар, бондарь) и по характеру одинаково распространены.

Фамилия образована по продуктивной для русской ономастики модели: прозвище Лагунец (человек, имеющий отношение к лагуну — либо делающий бочонки, либо ленивый) плюс патронимический суффикс -ов, дающий форму Лагунцов. Суффикс -ец в основе указывает на принадлежность к определённому типу: так называли «человека, связанного с предметом или свойством». То есть Лагунец — не просто «бочка», а «тот, кто с бочкой» или «тот, кто ленив, как бочка».

Географически фамилия Лагунцов тяготеет к южнорусским и центральным областям — Воронежской, Тамбовской, Рязанской, а также встречается на Дону. Слова «лагун» и «лагунь» фиксируются именно в этих говорах. В северных и сибирских регионах эта фамилия редка.

В написании возможны варианты: Лагунцов и Лагунцев. Форма Лагунцова — стандартное окончание для женской фамилии в русском языке, указывающее на принадлежность к роду Лагунцовых.

Социальный состав носителей в прошлом — в основном крестьяне и ремесленники. Фамилия недворянская, что подтверждается её «ремесленной» или «характерологической» основой и отсутствием в родословных книгах. В современных телефонных справочниках и базах данных Лагунцовы встречаются нечасто, но стабильно — фамилия не угасла, хотя и не стала массовой.