Фамилия Лагунова восходит к прозвищу Лагун. Маловероятно, что оно восходит к итальянскому слову lagun, которое означает «озеро морской воды, озеро или ковш (залив с узким перехватом), отделенный от моря». Скорее всего, прозвище происходит от созвучного слова «лагуна» — «бочка, бочонок». Вероятно, Лагуном называли того, кто мастерил бочки для различных хозяйственных нужд. Не исключено, что прозвище Лагун мог получить толстый, неповоротливый человек. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Лагун, со временем получил фамилию Лагунова.