Фамилия Лагуненко построена по типичной для украинских и южнорусских земель модели с суффиксом -енко, который исторически означал «сын» или «потомок». В основе фамилии лежит прозвище или нецерковное имя Лагун. Дальнейший разбор упирается в значение этого слова, и здесь возможны несколько версий, каждая из которых по-своему описывает возможного предка.

Самая прямая версия отсылает к диалектному слову «лагун» — так в южных и западных говорах называли бочонок, кадку или деревянный сосуд. Если исходить из этой основы, прозвище мог получить либо бочар — мастер, делавший бочки, либо человек, торговавший ими. В крестьянском быту бондарь был уважаемым ремесленником, поэтому профессиональное прозвище легко переходило в фамилию.

Вторая версия связывает Лагуна не с ремеслом, а с внешностью. Полного, плотного человека в народе могли в шутку сравнить с бочонком — так прозвище Лагун закреплялось за ним. На Руси полнота не считалась недостатком, а скорее говорила о здоровье и достатке, поэтому прозвище не несло обидного оттенка.

Третья, менее очевидная гипотеза выводит Лагуна из уменьшительной формы крестильного имени Лонгин (от латинского longus — «длинный, долгий»). В народном произношении имя Лонгин нередко сокращалось и искажалось, и форма Лагун — одна из возможных. В таком случае фамилия Лагуненко означала бы «сын Лагуна», то есть потомка человека по имени Лонгин.

Какая из версий правдоподобнее? Профессиональное прозвище от названия предмета (бочонок) встречается в фамилиях гораздо чаще, чем редкая народная форма крестильного имени. К тому же слово «лагун» в значении «бочка» хорошо зафиксировано в украинских и белорусских говорах, что идеально совпадает с ареалом фамилий на -енко. Поэтому основным значением фамилии Лагуненко стоит считать «потомок бочара» или «сын человека по прозвищу Бочонок».