Фамилия Лахоткина — женская форма фамилии Лахоткин. Её основа — прозвище или неканоническое имя Лахотка. В русской ономастике суффикс -к- часто указывает на уменьшительную или уничижительную форму, так что Лахотка — это, скорее всего, уменьшительное от Лахота или Лахоть.

Корень «лах-» в русских говорах неоднозначен. В диалектах северо-запада и центра России слово «лахота» могло означать «лохмотья», «ветхая одежда», «обноски». Отсюда Лахотка — человек, ходящий в рванье, или же неряшливый, неопрятный. В южных и западных говорах «лах» встречается в значении «слякоть», «грязь», «жижа» (ср. «лахта» — лужа, болотце). Если исходить из этого, прозвище могло пристать к тому, кто жил у болота или постоянно пачкался.

Есть и вторая, менее очевидная версия: Лахотка может быть производным от имени Евлампий, Евлампия — через народные формы Лампа, Лампотка, которые под влиянием аканья превратились в Лахотку. Такое переосмысление церковных имён в крестьянской среде — обычное дело. Правда, фонетический переход «м» в «х» нетипичен, поэтому эта версия слабее.

Суффикс -ин в фамилии Лахоткин указывает на принадлежность: «сын Лахотки» или «из семьи Лахотки». Такая модель типична для северных и центральных регионов России, где -ин закрепился у фамилий, образованных от слов на -а, -я. Географически фамилия встречается разрозненно, но чаще в Вологодской, Костромской и Кировской областях — то есть как раз в зоне бытования диалектного слова «лахота» в значении «рубище».

В дореволюционных метрических книгах Лахоткины записаны в основном как крестьяне и мещане. Сословный потолок — низшие городские слои и сельские жители. Дворянских ветвей с такой фамилией не зафиксировано.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Лахтин, Лахов — показывает, что все они идут от той же диалектной лексики, но с разными суффиксами. Лахоткин выделяется именно уменьшительной формой, что придаёт прозвищу оттенок бытовой насмешки или жалости.