Фамилия Лепунов образована от личного прозвища и относится к распространенному типу русских фамилий. Фамилия Лепунов образована от прозвища Лепун, которое восходит к глаголу «лепить». Так, предок обладателя фамилии Лепунов мог заниматься гончарным делом или делал мазанки. Иногда Лепуном называли и того, кто все делал излишне поспешно. Кроме того, нельзя исключить связь прозвища с нарицательным «лепуха» - «короста». Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Лепан, со временем получил фамилию Лепунов. О точном месте и времени возникновения фамилии Лепунов в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Лепунов представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.