Фамилия Лепустина — вариант женского рода от фамилии Лепустин. В основе лежит прозвище или нецерковное имя Лепуста. В русской ономастике это слово имеет два основных объяснения, и оба ведут к бытовой, негородской среде.

Первая и самая прямая версия: «лепуста» — диалектное название лепёшки, пресного хлеба, часто из гороховой или гречневой муки. В говорах встречается и форма «ляпуста», «ляпушка» — то же самое. Прозвище Лепуста могли дать либо пекарю, либо человеку, который любил или часто ел такие лепёшки. Вторая версия связывает слово с глаголом «лепить» — в значении «делать небрежно, кое-как». Тогда Лепустой называли неряшливого, неаккуратного человека, «лепушника» — того, кто делает всё на скорую руку. Оба толкования правдоподобны и не противоречат друг другу: прозвище могло родиться и в кухне, и в мастерской.

Суффикс -ин указывает на типичную русскую модель образования фамилий от основ на -а/-я: Лепуста → сын Лепусты → Лепустин. Такие фамилии чаще всего встречались в северных и центральных губерниях России, где были сильны традиции прозвищ по ремеслу или бытовой черте. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые образовывались от имён и прозвищ на твёрдый согласный, -ин характерен для «женских» по форме основ, хотя сам прозвище могло принадлежать мужчине.

Фамилия редкая. В дореволюционных переписях она не фиксировалась массово, что говорит о её локальном, возможно, однодворческом или крестьянском происхождении. В современных базах данных носители Лепустины встречаются в основном в Поволжье и на Урале — регионах, куда в XVIII–XIX веках активно переселялись крестьяне из центральных губерний. Связи с дворянскими родами или известными историческими личностями не прослеживается: это фамилия человека, чей предок получил уличное прозвище за привычку печь лепёшки или за небрежную работу.