Фамилия Летун образована от личного прозвища и относится к распространенному типу украинско-белорусских фамилий. Прозвище Летун ведет свое начало от аналогичного нарицательного со значением «тот, кто быстро передвигается, мчится, скачет и т.п.». Так могли назвать человека проворного, торопливого, который очень быстро ходит. В некоторых говорах «летун» - это злой воздушный дух.