Фамилия Липянина — женская форма, а её мужской вариант — Липянин. В русской традиции такие фамилии редки и указывают на происхождение не от отца (как обычные -ов/-ев или -ин), а от географического названия или прозвища, которое закрепилось за родом. Суффикс -ин здесь работает иначе: если в фамилиях типа «Иванов» он указывает на принадлежность («чей?»), то в «Липянин» он, скорее всего, часть основы, а не патронимический показатель.

Основа фамилии — слово «липяный» или «липяной». В русских говорах так могли называть человека, связанного с липой: живущего в липовой роще, занимающегося заготовкой липового лыка (мочала) или изготовлением из него коробов, лаптей. Липа на Руси была важнейшим промысловым деревом — из её коры драли лыко, поэтому прозвище Липяня мог получить мастер-лыкодёр или крестьянин, чья земля граничила с липняком.

Версия с топонимом не менее правдоподобна. В России есть несколько мелких населённых пунктов с корнем «Лип» — деревни Липяны, Липяги, Липянка. Выходец из такой деревни мог получить прозвище Липянин («житель Липян»), которое затем закрепилось как фамилия. Такая модель образования характерна для северных и центральных регионов России, где фамилии на -анин (позже сокращённые до -ин) встречаются чаще: Москвин, Тверитин, Пермяков.

Фамилия Липянина — редкая. Она почти не встречается в старых дворянских родословных, что говорит о крестьянских или мещанских корнях. В современных справочниках её носители фиксируются в основном в Вологодской, Архангельской и Кировской областях — на территории бывших новгородских и вятских земель, где липовый промысел был распространён.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Липкин, Липатов, Липский — показывает, что Липянин стоит особняком. Если Липкин образован от уменьшительного имени (Липка), а Липатов — от греческого имени Ипатий, то Липянин прямо указывает на связь с местом или занятием. Это делает фамилию более «прозрачной» для этимолога, но не менее интересной: за ней стоит не имя святого или прозвище по внешности, а конкретный бытовой или географический контекст.