Фамилия Лишик происходит от прозвища, которое, скорее всего, связано со словом «лис». Чередование согласных с/ш в корне — характерная черта западнославянских языков: в чешском «lišák», в старом польском «liszka». Поэтому прозвище Лишик могло указывать на хитрый нрав предка или на его рыжие волосы. Такая версия — самая прямая и правдоподобная.

Есть и другая, менее очевидная гипотеза. Прозвище могли образовать от белорусского «лiшка» или русского «лиш» («лишь»), то есть «избыток». В этом случае основатель рода мог быть очень обеспеченным человеком. Но эта версия слабее: фамилии от «лишний» обычно выглядят иначе (Лишний, Лишнов), а форма на -ик чаще встречается именно в уменьшительных или «звериных» прозвищах.

Суффикс -ик в фамилии — типично западнорусский, украинский и белорусский. Он указывает на прозвище, которое не переделали в притяжательное прилагательное (как Иванов или Соколов), а оставили в исходной форме. Такие фамилии распространены на западе современной России, в Беларуси и на Украине.

Исторические записи подтверждают западное происхождение фамилии. В Книге памяти Амурской области упомянут поляк Иван Иванович Лишик, родившийся в 1915 году в Брестской области. А в Книге памяти Ставропольского края есть белорус Иван Яковлевич Лишик (р. 1889) из деревни Молдовичи. Оба случая связывают фамилию с западнославянскими и балто-славянскими землями, где чередование с/ш в корне «лис» — обычное дело.

Таким образом, фамилия Лишик — скорее всего, прозвище хитрого или рыжего человека, закрепившееся в западной части славянского мира.