Фамилия Лисиков образована по одной из самых распространённых в русском языке моделей — от прозвища или имени через суффикс -ов. Основа здесь — «Лис» или «Лисик». Это не случайное совпадение: фамилия напрямую связана с названием животного, лисы.

Прозвище Лис или Лисик на Руси давали не только за хитрость, хотя это качество закрепилось за лисой в фольклоре. Ономасты (например, Б. Унбегаун в «Русских фамилиях») указывают, что звериные прозвища часто отражали внешность: рыжий цвет волос, острое лицо, узкие глаза. Реже — манеру поведения: льстивость, изворотливость, умение выкрутиться из неприятностей. Второй вариант основы — уменьшительная форма «Лисик» (как «зайчик» или «волчок»), которая могла быть домашним, ласковым прозвищем.

Суффикс -ов указывает на типичное патронимическое происхождение: «чей?» — Лисиков, то есть сын Лисика. Такое окончание чаще всего носили крестьяне и мещане центральных и северных губерний России. В южных и западных регионах (Украина, Белоруссия) та же основа чаще оформлялась суффиксом -енко (Лисенко) или -ук (Лисюк). Таким образом, Лисиков — фамилия с чёткой географической привязкой к исконно русским территориям.

Интересная деталь: у фамилии Лисиков есть «двойник» — Лисицын. Обе образованы от одного зверя, но разными путями. Лисицын — от полной формы «Лисица», а Лисиков — от краткой «Лис» или уменьшительного «Лисик». В некоторых говорах «лисиком» могли называть не только рыжего человека, но и того, кто занимался лисьей охотой или выделкой лисьих шкур — промыслом, распространённым в лесной полосе России. Сословной принадлежности у фамилии нет: носителями Лисиковых были и крестьяне, и однодворцы, и купцы — прозвище не несло социальной окраски.