Фамилия Лиски — это не просто вариант написания слова «лиса», а прозвище, закрепившееся в родовом имени. Её основа восходит к прилагательному «лысый», которое в некоторых русских говорах произносили как «лисый». Человек, получивший такое прозвище, мог быть лысым, но не обязательно: в народной традиции «лысым» нередко называли опытного, бывалого человека, прошедшего огонь и воду. Есть и другая версия: в тех же говорах слово «лисый» иногда означало «желтый». Тогда прозвище Лиски могли дать человеку со светло-рыжими волосами или особенным цветом лица.

Сама фамилия образована по продуктивной модели: к основе «Лиск-» добавили суффикс -и, который в русской ономастике типичен для кратких притяжательных форм (сравните: «чей? — Лискин», но со временем фамилия застыла в форме множественного числа). Такая модель встречается реже, чем фамилии на -ов или -ин, и характерна скорее для северных и центральных областей России, где в ходу были фамилии-«прозвища» без дополнительных суффиксов.

Интересно, что фамилия Лиски не имеет отношения к названию города Лиски в Воронежской области: топоним там более поздний и связан с речным названием. Зато в старых писцовых книгах можно встретить крестьян и посадских людей с прозвищем Лиско — это уменьшительная форма от того же «лисый». Со временем прозвище перешло в фамилию, сохранив память о внешности или характере предка.