Фамилия Лодоркин — редкий случай, когда прозвище или имя, лёгшее в основу, с трудом поддаётся однозначной расшифровке, и это делает её особенно интересной для этимолога. Первое, что бросается в глаза, — суффикс -ин. В русских фамилиях он указывает на принадлежность: «чей сын?» — Лодоркин, то есть сын Лодорки. А вот с самим именем Лодорка начинаются загадки.

Самая вероятная версия отсылает к греческому имени Лаодика или Лаодора, которое попало в русские святцы через византийскую традицию. В народном произношении такие длинные имена часто усекались и переделывались на свой лад: Лаодор мог превратиться в Лодора, а уменьшительная форма — в Лодорку. Если это так, то предок носителя фамилии был крещён именем Лаодик или Лаодор, а его сына в быту звали Лодоркиным. Путь от календарного имени к просторечной форме — один из главных источников русских фамилий, и Лодоркин здесь не исключение.

Вторая версия, менее распространённая, но имеющая право на существование, — прозвищное происхождение от диалектного слова «лодор». В некоторых говорах так могли называть неуклюжего, неповоротливого человека или, наоборот, того, кто «лодырничает», то есть бездельничает. Связь с современным словом «лодырь» здесь прослеживается, но не прямая: «лодырь» восходит к немецкому Luder или польскому łodr, а «лодор» могло быть местным вариантом. Однако для фамилии, зафиксированной в документах, церковное имя остаётся более надёжным объяснением. Словарь Б. Унбегауна по русским фамилиям подтверждает, что суффикс -ин характерен для форм, образованных от имён на -а/-я, а такие имена, как Лаодор, хоть и редко, но встречались в метрических книгах.

Географически фамилия Лодоркин тяготеет к центральным и южным регионам России, встречается в архивах Воронежской, Тамбовской и Рязанской губерний. Это косвенно подтверждает версию о крестьянском или мещанском происхождении: в этих местах фамилии на -ин часто давали по имени отца, без сословных претензий. Дворянских родов с такой фамилией история не знает — Лодоркины, скорее всего, были людьми простого звания, чьё имя осталось в памяти потомков как единственное наследство.

В написании фамилии возможны варианты: Лодаркин, Лодоркин, реже Ладоркин. Путаница возникает из-за безударной гласной в корне: в разговорной речи «о» и «а» звучат одинаково, поэтому в документах могли записать на слух. Но исторически верным считается написание через «о» — как в исходном имени Лаодор.