Фамилия Лодята — редкий пример, где суффикс указывает на происхождение точнее, чем корень. Модель образования здесь архаичная: суффикс -ята (в современном звучании -ята) в русских фамилиях обычно обозначал «сына» или «потомка» человека, названного в основе. Это типично для северных и сибирских говоров, где фамилии на -ята (вроде Собята, Корята) фиксировали принадлежность к роду без добавления стандартных -ов или -ин. Лодята, таким образом, — «сын Лоди» или «из рода Лоди».

Корень «Лод-» неоднозначен. Самая прямая версия — от слова «лодья» (большая гребная лодка, ладья). В древнерусском языке «лодья» — распространённое судно, и прозвище Лодя могли дать лодочнику, судостроителю или перевозчику. Вторая версия — от уменьшительной формы имени Владимир: в народной речи Владимир превращался в Володю, а Володя — в Лодю (через отпадение начального слога, как в случае с Лавр от Лаврентий). Если так, то Лодята — потомок некоего Лоди, то есть Владимира. Третья, менее вероятная версия — от диалектного «лодый» (ленивый, неуклюжий), но она не находит устойчивого подтверждения в ономастических словарях.

Фамилия почти не встречается в центральных губерниях, её ядро — северо-запад и Русский Север: Новгородская, Архангельская, Вологодская области. Именно там было развито судоходство по рекам и озёрам, и там сохранялись архаичные словообразовательные модели. В писцовых книгах XVI–XVII веков можно найти крестьян с прозвищем Лодя, но фамилия в её современном виде закрепилась позже, в основном среди государственных крестьян и мещан. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано.

Интересно, что фамилия Лодята не имеет однокоренных «конкурентов» с другими суффиксами: Лодин, Лодьин или Лодейников встречаются чаще, но они образованы по другим моделям. Лодята стоит особняком — как реликтовая форма, сохранившая память о древнем способе называть человека по отцу без помощи патронимических суффиксов.