Фамилия Логацький — редкий случай, когда географический суффикс встречается с основой, которая может быть и польской, и украинской, и белорусской. Суффикс -цьк- (в русской передаче часто -цк-) вместо привычного -ск- указывает на западнорусское или польское происхождение: так оформлялись фамилии шляхты и мещан на землях бывшей Речи Посполитой. Скорее всего, перед нами вариант фамилии Логацкий, где мягкий знак возник из-за особенностей украинского произношения или при адаптации в польской орфографии.

Основа Логац- восходит к имени Лога, которое в свою очередь — народная форма крестильного имени Лонгин (от латинского longus — «длинный») или, реже, сокращение от имени Глеб через диалектные перестановки звуков. В украинских и белорусских говорах имя Лонгин нередко звучало как Логін, а уменьшительное Лога дало прозвище. Соответственно, Логацький — это «потомок Логи» или «тот, кто из рода Логов».

Версия с польским шляхетским происхождением тоже имеет право на существование. В польской ономастике фамилии на -цкий были типичны для гербовой шляхты, и Логацький мог образоваться от названия местечка Логаты или Логачи (гипотетические топонимы, не сохранившиеся в современных атласах). Однако документальных подтверждений этой версии нет, поэтому бытовое происхождение от прозвища выглядит правдоподобнее.

Есть и более прозаичный вариант: основа могла быть связана с диалектным глаголом «логать» — в некоторых говорах так называли болтать, пустословить или, наоборот, ловить рыбу бреднем. Тогда Логацький — потомок болтуна или рыбака. Но эта версия спорная, так как глагол редкий и локальный.

Географически фамилия Логацький встречается в основном на западе Украины (Волынь, Ровенщина, Тернопольщина) и в юго-восточной Польше. В России она почти не фиксируется, что подтверждает её западнорусские корни. Носители фамилии, скорее всего, были мещанами или однодворцами — людьми, которые несли службу, но не имели крепостных, и жили на границе польского и русского влияния.