Фамилия Логунины — наглядный пример того, как за привычным окончанием «-ин» может скрываться сразу несколько версий происхождения, и ни одну из них нельзя сбрасывать со счетов. Самая прямая линия ведет к крестильному имени Лонгин (в просторечии — Логгин). В русской традиции это имя часто «укорачивали» до Логуня, а уже от этой обиходной формы и образовали фамилию. Латинское longus, от которого происходит Лонгин, означает «длинный» или «высокий» — имя давали в честь сотника Лонгина, который, по преданию, пронзил копьем ребро распятого Христа.

Но есть и вторая, бытовая версия. На Руси словом «логуниться» или «логозиться» называли склонность к ссорам и пререканиям. В этом случае прозвище Логуня получал заядлый спорщик, человек, с которым трудно договориться. Такая модель образования фамилий от прозвищ по характеру — одна из самых распространенных.

Третья версия отсылает к географии. Слово «лог» означает широкий овраг, поросший травой, или ложбину. Прозвище Логуня могло закрепиться за человеком, жившим у такого оврага. В русских говорах слово «лог» встречается повсеместно, поэтому региональная привязка фамилии размыта.

По суффиксу «-ин» видно, что фамилия образована от основы на -а/-я (Логуня), что типично для северных и центральных областей России. В отличие от фамилий на «-ов», которые чаще возникали от имен и прозвищ на согласный, «-ин» указывает на принадлежность: «чей сын?» — «Логунин». О точной дате появления фамилии говорить сложно, но модель «имя/прозвище + -ин» активно работала в XV–XVII веках, когда крестьянские и посадские фамилии только начинали закрепляться.