Фамилия Логушков — редкий случай, когда суффикс -ов скрывает за собой не просто отчество, а прозвище с затемнённой внутренней формой. В основе лежит слово «логуш» или «логушка», и тут возможны два объяснения, причём одно из них почти наверняка ошибочное, но очень соблазнительное.

Самое прямое, что приходит на ум, — связь с «логом», то есть оврагом, низиной, балкой. В говорах «логушком» могли называть либо человека, жившего в такой низине, либо того, кто постоянно ходил по сырым, низким местам. Однако у этого слова есть и другое, менее очевидное значение: в некоторых диалектах «логуш» — это небольшой деревянный ковш, черпак, иногда даже бочонок для воды. Такое прозвище мог получить бондарь, изготовлявший подобную утварь, или же человек, которого в шутку сравнивали с этой ёмкостью — например, за привычку много пить.

Третья версия, которую иногда встречаешь в любительских этимологиях, — производное от имени Логгин (в просторечии Логуй). Но здесь подвох: от имени Логгин образуются фамилии Логинов, Логунов, Логинцев. Форма «Логуш» нехарактерна для народных вариантов этого имени, поэтому версия с прозвищем выглядит гораздо убедительнее.

Суффикс -ков в фамилии Логушков нестандартен. Обычно от прозвища на -уш (Логуш) образовывали бы фамилию Логушин, а здесь использован патронимический суффикс -ов, что указывает на более позднюю, книжную фиксацию. В XIX веке, при переписях, священники и писцы часто записывали фамилии по своему разумению, прибавляя стандартное -ов к любой основе, даже если народная традиция требовала другого окончания. Так Логуш, сын некоего Логуша, превратился в Логушкова.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским и украинским областям, где слово «лог» (балка) и его производные — часть повседневного пейзажа. Встречается она нечасто, и носители её, скорее всего, происходят из крестьянской среды, где прозвища по месту жительства или по ремеслу были обычным делом. Никаких дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано, так что предки Логушковых — простые люди, жившие у оврагов или делавшие деревянные ковши.