Фамилия Логушкова — женская форма, мужской вариант Логушков. В её основе лежит прозвище или нецерковное имя Логушок, которое в свою очередь образовано от слова «лог». Лог — это овраг, балка, низина, поросшая кустарником. Такие прозвища по месту жительства были широко распространены: человека, жившего у глубокого оврага, могли прозвать Логом или Логушком. Уменьшительный суффикс -уш-/-юш- здесь не столько указывает на малый размер, сколько передаёт бытовую, фамильярную окраску — так могли назвать младшего в семье или просто невысокого человека, чей дом стоял у лога.

Фамилия образована по продуктивной модели с суффиксом -ов-, который в русских фамилиях чаще всего указывает на принадлежность: «сын Логушка». Встречаются и однокоренные фамилии — Логов, Логунов, Ложкин, но Логушков стоит несколько особняком из-за редкой уменьшительной формы. В говорах слово «логушок» могло также означать не только овраг, но и небольшую ложбину, что делает фамилию географически привязанной к регионам с овражным рельефом — средней полосе России, Поволжью, южным областям.

Менее вероятная, но возможная версия связывает фамилию с диалектным глаголом «логушить» — говорить впустую, болтать. Однако прозвища от подобных глаголов обычно образуются с суффиксами -ун или -ач (Логун, Логач), а форма Логушок явно тяготеет к предметному, а не глагольному значению. Словарь русских фамилий Б. Унбегауна относит такие модели к типично русским, основанным на прозвищах от ландшафтных терминов.

По сословной принадлежности носители фамилии Логушковы чаще всего были крестьянами или однодворцами. В документах XVIII–XIX веков эта фамилия встречается в Тамбовской, Рязанской и Воронежской губерниях — в чернозёмной зоне, где овраги и балки — характерная черта рельефа. Фамилия редкая, не аристократическая, что делает её типичным образцом народной ономастики, где географическая среда напрямую запечатлелась в родовом имени.