Фамилия Лондаренко образована по типичной украинской модели: к основе прозвища Лондарь добавили суффикс -енко, который означает «сын» или «потомок». То есть Лондаренко — буквально «сын Лондаря». Само прозвище Лондарь, скорее всего, фонетический вариант прозвища Ландарь, которое связывают с украинским словом «ландара» — повозка, карета. В русском языке есть похожее слово «ландо», заимствованное из французского: так называли четырехместный экипаж с откидным верхом, который служил и каретой, и коляской. Поэтому Ландарем (а затем и Лондарем) могли прозвать мастера, который делал или чинил такие экипажи.

Есть и другая версия, хотя и менее убедительная: прозвище Ландарь могли дать выходцу из села Ландари, которое находится в Полтавской области на Украине. В этом случае фамилия указывала бы на место, откуда человек родом, а не на его ремесло. Но каретный мастер — объяснение более конкретное и наглядное.

Фамилия бытовала в разных губерниях. В Книге памяти Томской области упоминается Лондаренко Иван Иванович, родившийся в 1870 году в селе Бондаревка Суджанского района Курской области. Это показывает, что носители фамилии жили не только на Украине, но и в южнорусских областях, откуда потом переселялись в Сибирь.