Фамилия Лотис — редкая, и её происхождение неочевидно. В русском языке у неё нет привычного суффикса (-ов, -ин, -ский), что указывает на позднее закрепление или нерусские корни. Скорее всего, перед нами фамилия латышского или литовского происхождения, где окончание -ис — стандартный грамматический показатель мужского рода. В таком случае основа «Лот-» восходит к личному имени Лотис — краткой форме от латышского Лотхар или немецкого Лотар. В Латвии и Литве фамилии с таким окончанием встречаются часто, и носитель мог быть потомком крестьянина или ремесленника из Курляндии или Жемайтии.

Есть и вторая версия, менее вероятная, но не исключённая: фамилия могла возникнуть в среде русских старообрядцев, которые селились в Прибалтике. В этом случае Лотис — искажённое Лот (жребий) или прозвище по занятию: «лотис» в некоторых говорах означало «лодочник» или «перевозчик» (от «лотка» — лодка). Однако в словарях русских говоров это слово не зафиксировано как распространённое, поэтому версия с балтийским именем выглядит убедительнее.

Встречаемость фамилии сегодня — единичные семьи в России, в основном на северо-западе (Псковская, Ленинградская области) и в Латвии. В дореволюционных метрических книгах Лотисы могли записываться через «о» или «а» (Латис), но единого написания не было. Известных носителей с этой фамилией, оставивших след в истории, нет — фамилия осталась в тени, что типично для поздних и малочисленных родов.