Фамилия Лугинова образована по самой распространённой в русском языке модели — от основы на -а с помощью суффикса -ин. Это указывает на то, что в основе лежит имя или прозвище Лугин, которое, в свою очередь, происходит от прилагательного «лугой» или существительного «луг». В древнерусском языке «лугой» означало «луговой», «относящийся к лугу», а «луг» — не только сенокосное угодье, но и травянистая равнина, пойма реки.

Прямых сведений о конкретном Лугине, давшем фамилию, нет, но логика проста: прозвище могли дать человеку, жившему у луга, владевшему лугом или пасшему на нём скот. В ономастике есть параллели: фамилии Луговой, Луговцев, Луговкин — все они отсылают к тому же корню. Однако Лугинова выделяется редким суффиксальным вариантом: не -ов/-ев, а -ин, что типично для прозвищ на -а/-я (ср. Козин от Коза, Сорокин от Сорока). Значит, исходное прозвище Луга — женского рода или же образовано от усечённой формы мужского имени (например, от Луган — «житель луга»).

Интересно, что фамилия Лугинова встречается в основном на Русском Севере и в Поволжье — в Архангельской, Вологодской, Кировской областях, а также в Чувашии. Это может говорить о том, что предки носителей фамилии были крестьянами, чей быт и хозяйство были тесно связаны с пойменными лугами. В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» модель на -ин от прозвищ, оканчивающихся на -а, считается архаичной, что подтверждает северное происхождение фамилии.

Споров о значении корня нет: все версии сходятся на «луге». Единственная альтернативная гипотеза — связь с диалектным «луг» в значении «лесная опушка» или «поляна» — не противоречит основной, а лишь уточняет ландшафт. Фамилия Лугинова не относится к дворянским или купеческим — это типичная крестьянская фамилия, которая могла закрепиться в XV–XVII веках, когда на Руси начали массово давать фамилии по месту жительства или занятию.