Фамилия Луньков — одна из тех, где за простым звучанием скрывается несколько возможных историй. Самая очевидная версия отсылает к прозвищу Лунька, а оно — к хищной птице лунь из семейства ястребиных, у которой самцы отличаются серовато-белым оперением. В древности на Руси было принято давать детям «птичьи» имена-обереги: считалось, что так природа примет ребёнка за своего и передаст ему нужные качества. Кроме того, если человек был седым или светловолосым, его могли прозвать Луньком за внешнее сходство — отсюда и поговорка «седой как лунь».

Но есть и другие пути, по которым могла появиться эта фамилия. Основа «лунк-» может указывать на «лунку» — ямку или впадину. Тогда прозвище Лунька получал либо земледелец, либо рыбак (лунка во льду), либо человек, живший в бугристой местности с ямами и оврагами. Это бытовое, чисто русское прозвище, не связанное с животным миром.

Третья версия — сокращение от крестильного имени Лука (от латинского «светоносный»). В народной речи имя Лука нередко превращалось в Луню или Луньку, а от них уже пошла фамилия. Такой путь образования через уменьшительную форму имени — один из самых частых для русских фамилий на -ов.

Суффикс -ов в фамилии Луньков указывает на принадлежность: «чей?» — сын Луньки. Эта модель типична для центральной России и севера. Фамилия не относится к числу редких, но и не слишком распространена — чаще всего её корни стоит искать в Псковской, Новгородской или Тверской областях, где и птица лунь, и диалектное слово «лунька» были в ходу.