Фамилия Лунюк — характерный пример восточнославянской модели фамилий на -юк. Этот суффикс, распространённый прежде всего на западе Украины и в Беларуси, указывает на происхождение от имени или прозвища предка: Лунюк — буквально «потомок Луня». Основа здесь — прозвище Лунь, которое могло возникнуть от названия птицы семейства ястребиных. Лунь — хищная птица с характерным светлым оперением и плавным, скользящим полётом. В народе такое прозвище давали либо человеку с седыми или светлыми волосами, либо тому, кто двигался бесшумно и плавно, либо, реже, — хитрому и осторожному, «птичьего» склада характера.

В отличие от более частых фамилий на -ов/-ев или -ин, модель на -юк не была массовой в центральной России. Она удерживалась в тех регионах, где долго сохранялась традиция именования по отцу с помощью патронимического суффикса: Лунюк — сын Луня. Это сближает фамилию с такими же образованиями, как Ковалюк (сын кузнеца), Грицюк (сын Григория) или Павлюк. Встречаемость фамилии Лунюк в современных базах данных невысока, но она стабильно фиксируется в западных областях Украины — на Волыни, Ровенщине, а также среди потомков переселенцев в Сибири и на Дальнем Востоке.

Спорных версий у этой фамилии немного. Иногда основу пытаются связать с глаголом «лунить» — в некоторых говорах «лупить», «бить», но это сомнительно: прозвище от действия с таким значением скорее дали бы в форме Луп или Лупа, а не Лунь. Более правдоподобна связь с диалектным «лунь» в значении «пустой, никчёмный человек» — такая параллель есть в русских говорах, но для фамилии Лунюк она вторична. Первичным, скорее всего, остаётся птичье прозвище: оно и понятнее, и типичнее для народной антропонимии.

Таким образом, предок носителя фамилии Лунюк, вероятно, жил в западных землях и получил уличное прозвище Лунь — по внешности, походке или повадке. Со временем это прозвище закрепилось за его потомками как фамилия, и суффикс -юк ясно указал на родство: «чей ты будешь?» — «Лунюк».