Фамилия Лужанина — женская форма от Лужанин, и её разбор стоит начать не с корня, а с суффикса. Модель «основа + -анин» в русских фамилиях редка и почти всегда указывает на происхождение из конкретного места: «кто? откуда?» — так же, как Москвитин, Тверитин или Пермяков. Лужанин — это человек с Лужи, то есть из села, деревни или урочища с названием Лужа. Таких топонимов в России немало: например, Лужа в Калужской области или Лужаны в Кировской, да и просто «лужа» как географический термин (низина, заливной луг, болотистое место) могла дать имя поселению.

Основа «луж-» — не от бытовой лужи с водой, а от древнерусского «лугъ» (луг, низина, пойма). В говорах «лужа» нередко означала заливной луг или мочажину, где пасли скот. Поэтому прозвище Лужанин могли дать человеку, жившему у такого места или пришедшему из деревни Лужа. В отличие от фамилий на -ов/-ин, которые образуются от личных имён или прозвищ, суффикс -анин сразу привязывал носителя к местности, и такая модель была типична для северных и центральных регионов России, особенно в XVI–XVII веках.

Форма Лужанина — это либо жена Лужанина, либо дочь; в документах такие фамилии встречаются чаще у крестьянок и мещанок, где фамилия ещё не устоялась в мужском роде. В современных списках Лужанина — редкая фамилия, её носительницы живут в основном в Поволжье и на Урале, что косвенно подтверждает миграцию из центральных областей. Однокоренные фамилии — Лужин, Лужаев, Лужков — образованы по другим моделям (от прозвища или отчества), и Лужанина стоит среди них особняком именно из-за топонимического суффикса. Никаких данных о дворянском происхождении или знаменитых носителях нет — фамилия осталась в крестьянской среде, что для неё типично.