Фамилия Ляксина образована от прозвища Лякса. Чаще всего его связывают с глаголом «лякать» — пугать. В таком случае Ляксой называли человека пугливого, боязливого. Но есть и другие версии. В северных говорах «лякий» означало «горбатый, сутулый» — тогда прозвище указывало на внешность. Архангельское слово «ляп» — это деревянная колотушка для глушения рыбы, а «лякса» — название одного из видов форели. Не исключено, что прозвище дали рыбаку или человеку с «рыбьей» фамильной чертой.

Менее вероятна, но любопытна версия о заимствовании из английского lax — «вялый, слабый» или «небрежный». Она объяснима лишь в случае, если предки Ляксиных имели контакты с иностранцами, что для большинства русских фамилий редкость. Правдоподобнее всё же славянская основа, тем более что суффикс -ин типичен для русских фамилий, образованных от прозвищ на -а: Лякса → Ляксин → Ляксина.

Географически фамилия встречается в основном на Русском Севере и в Поволжье, что косвенно подтверждает связь с архангельскими говорами. О точном времени возникновения говорить сложно: фамилия складывалась постепенно, но по модели образования её относят к XVI–XVII векам.