Фамилия Лыпина — женская форма, в основе которой лежит мужская фамилия Лыпин. А её модель образования проста и прозрачна: суффикс -ин указывает на принадлежность. В русской традиции такие фамилии обычно означали «сын такого-то» или «из семьи такого-то». То есть Лыпин — это «сын Лыпы», а Лыпина — «дочь или жена Лыпина». Ключевой вопрос — что скрывается за прозвищем или именем Лыпа.

Самая вероятная версия связывает основу с диалектным словом «лыпа». В северных и сибирских говорах так называли липу — дерево, но с характерным местным произношением. Кроме того, «лыпа» могло быть прозвищем человека, чем-то напоминающего липу: например, высокого и стройного, или же, наоборот, медлительного и вялого (по аналогии с липкой, тягучей древесиной). Встречается и другая трактовка: в некоторых регионах «лыпа» означала «лысый» или «облезлый» — такое прозвище могли дать человеку с редкими волосами или плешью.

Менее распространённая, но возможная гипотеза — происхождение от уменьшительной формы крестильного имени. Например, от Филипп (в народной форме Липа) или от Олимпий. В таком случае Лыпа — это сокращение, а суффикс -ин стандартно закрепил фамилию. Однако эта версия слабее, потому что для имён Филипп и Олимпий более типичны формы «Лин» или «Липа», а не «Лыпа» с твёрдым ы.

Географически фамилия Лыпин (и, соответственно, Лыпина) встречается нечасто. Основные очаги — центральные области России и Поволжье, где слово «лыпа» было в ходу. Встречаются носители и на Урале, куда переселенцы принесли диалектную лексику. Сословно фамилия скорее всего крестьянская или мещанская: прозвища, связанные с внешностью или местными растениями, типичны для простонародной среды, где фамилии закрепились позже, в XVIII–XIX веках.

Таким образом, Лыпина — фамилия с ясной словообразовательной схемой, но с неоднозначной основой. Наиболее правдоподобно, что предок носителя получил прозвище Лыпа из-за внешности (лысина) или по ассоциации с липой. Спор о корне остаётся открытым, но диалектная природа слова не вызывает сомнений.