Основой фамилии Лыпко послужило мирское имя Лыпа. Мирские имена нередко полностью подменяли собой имена крестильные и могли выступать в документах в качестве официальных имен. Лыпа - это диалектный вариант названия дерева липа. Следует отметить, что мирское имя Лыпа относится к так называемым «охранительным» именованиям. Славяне вешали крестики из липы на шею человека, мучимого наваждениями. Это были притяжательные прилагательные с суффиксами –ов/-ев, -ко /-енко, изначально указывающие на имя главы семейства. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Лыпа, со временем получил фамилию Лыпко.