Фамилия Любякин — одна из тех, что хранят в себе не просто имя предка, а его прозвище, данное по душевному качеству. В её основе лежит мирское имя Любяка, которое, в свою очередь, образовано от глагола «любить». Скорее всего, так в семье ласково называли долгожданного или особенно любимого ребёнка. Подобные имена-пожелания (Любим, Любава, Мил) были распространены у славян задолго до появления фамилий: считалось, что имя станет оберегом и притянет к человеку то, что оно обозначает.

Модель образования фамилии — классическая для русского севера и центральных областей. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Любякин — это «сын Любяки». Обратите внимание, что основа здесь не усекается, что характерно для имён на мягкий согласный или гласный: от Любяка — Любякин, а не Любяков.

Существует и вторая версия, связывающая фамилию с женским именем Любовь и его производной формой Люба. Однако она менее убедительна. На Руси фамилии образовывали от имени отца как главы рода, а женские имена в качестве основы — большая редкость. Исключения возможны, но в случае с Любякиными версия с мужским мирским именем Любяка выглядит значительно правдоподобнее.

Фамилия эта встречается не повсеместно, а тяготеет к определённым регионам. Исторические записи фиксируют Любякиных в Нижегородской и Владимирской губерниях, а также в Сибири, куда фамилия попала с переселенцами из центральной России. Такая география — лишнее подтверждение её исконно русского, а не украинского или белорусского происхождения.