Фамилия Людинин образована по одной из самых распространённых в русской ономастике моделей — от личного имени или прозвища с помощью суффикса -ин. Этот суффикс указывает на принадлежность: Людинин буквально означает «сын Людины» или «из рода Людины». Вопрос в том, что скрывается за основой «Людин-».

Самое прямое объяснение отсылает к древнерусскому слову «людин» — так называли свободного простого человека, не знатного и не холопа. В Новгородской республике «людины» составляли основную массу горожан, противопоставленную боярам. Прозвище Людина могли дать человеку, который подчёркивал своё простое происхождение или, наоборот, держался независимо, с достоинством. С этой версией согласуется и то, что фамилия Людинин не выглядит аристократической — её носители, скорее всего, происходили из крестьян, ремесленников или посадских людей.

Менее вероятен, но возможен вариант от канонического имени Людим (редкая форма от Людимир). В этом случае фамилия следовала бы той же модели, что и Людимиров, но с другим суффиксом. Однако в исторических документах имя Людим встречается редко, а прозвище от нарицательного «людин» — намного чаще.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным областям России — Вологодской, Архангельской, Костромской. Именно там слово «людин» в значении «человек» сохранялось в говорах дольше всего. Встречаются и однокоренные фамилии: Людин, Людинов, Людинских — все они восходят к тому же корню, но различаются суффиксами и региональными особенностями.

В написании фамилии возможна путаница: иногда её путают с Людмилин (от женского имени Людмила) или с Людинов (от топонима Людиново). Но разница принципиальна: Людинин — от «людин» (человек), а не от имени. Эта фамилия — прямой потомок древнерусского социального термина, застывшего в форме отчества.