Фамилия Мадуева — женская форма от Мадуев, и ключ к её происхождению лежит в мужской основе. В русской традиции фамилии на -ев/-ов образуются от имён или прозвищ, оканчивающихся на согласный или -й. Здесь основа — Мадуй, что сразу указывает на тюркские корни. Слово «мадуй» (или «маду») в ряде тюркских языков, особенно в карачаево-балкарском и кумыкском, означает «медведь». Это не ласковое прозвище, а скорее «сильный», «неуклюжий» или «опасный» — типичный для прозвищной культуры образ зверя.

Модель образования проста: прозвище Мадуй плюс притяжательный суффикс -ев, то есть «сын Мадуя». Фамилия фиксируется преимущественно на Северном Кавказе, в среде тюркоязычных народов, но встречается и у русских, чьи предки могли получить её при крещении или при переезде из тех краёв. Интересная деталь: в отличие от фамилий на -ов, которые часто славянские, здесь суффикс наложился на нерусскую основу, что даёт чёткую региональную привязку к ареалу, где тюркские и русские ономастические традиции пересекались.

Версия о происхождении от личного имени Мадуй (возможно, сокращение от Магомед, Ахмад или другого мусульманского имени с потерей начала) менее правдоподобна: для таких сокращений нет устойчивой модели в тюркских языках Кавказа. Так что звериное прозвище — основной и самый логичный вариант. Социально предки носителей фамилии могли быть и крестьянами, и воинами — прозвище «медведь» не привязано к сословию, а скорее к личной характеристике или внешности.