Фамилия Магарський — редкий случай, когда географическая привязка почти наверняка перевешивает любую другую версию происхождения. Суффикс -ськ- (в русской передаче обычно -ск-) указывает на формирование фамилии по польской или украинской модели от названия места. В польском языке -ski — типичный показатель шляхетской или землевладельческой фамилии, образованной от названия имения или населённого пункта. В украинской традиции этот суффикс тоже распространён, но чаще у потомков казацкой старшины или духовенства.

Основа Магар- скорее всего восходит к топониму. На карте Восточной Европы есть несколько мест с похожим названием: например, село Магари (Магары) в бывшей Волынской губернии или Магар в нынешней Львовской области. Если предок носителя фамилии владел землёй или жил в таком месте, его потомки получали прозвание «с Магара» — Магарський. Менее вероятна, но возможна связь с тюркским словом «магар» (в значении «дар», «подарок»), которое могло стать прозвищем, но в сочетании с суффиксом -ськ- это выглядит натяжкой — такие основы обычно дают фамилии на -ов/-ев.

В польском ономастиконе фамилия Magarski встречается, но нечасто. В русском контексте она почти исчезла после переписей XX века, сохранившись в основном у потомков поляков или украинцев, переселившихся в центральные регионы. Сословно носители могли быть и мещанами, и шляхтой — фамилия на -ский сама по себе не гарантирует дворянства, но указывает на более высокий социальный статус предка по сравнению с крестьянином, получившим фамилию по отцу.

Написание через «а» в корне — норма для украинской и польской традиции; в русских документах могла встречаться вариантность «Магарский» или «Магарской». Сегодня фамилия редкая, и её носители, скорее всего, сосредоточены на западе Украины и в Польше, с единичными выходами в русскоязычную среду.