Фамилия Магазинер — одна из тех, что прямо указывает на род занятий своего первого носителя. Она относится к еврейским фамилиям, образованным от названия профессии. В основе лежит немецкое слово Magaziner, которое чаще всего переводят как «владелец магазина». Однако есть и другая, более узкая версия: в швейцарском варианте немецкого языка Magaziner означало «рабочий склада» (от Magazinarbeiter). Обе гипотезы не противоречат друг другу — и торговец, и складской работник имели дело с товаром и его хранением.

Модель образования фамилии проста: к немецкой основе добавили суффикс -er, который в немецком языке обозначает деятеля. В восточноевропейской еврейской среде такие фамилии на -ер (реже -ман) были распространены, поскольку немецкий долгое время служил языком делопроизводства и бытового общения у ашкеназов. Фамилия Магазинер не прошла через славянскую суффиксацию (-ов, -ин), поэтому сохранила исходный немецкий облик.

По сословной принадлежности предки Магазинеров, скорее всего, относились к мещанам или купцам — владельцам лавок и магазинов в местечках черты оседлости. Географически фамилия встречается в записях XIX века на территории современных Польши, Украины, Белоруссии и Литвы, а после эмиграционных волн конца XIX — начала XX века — в США, Аргентине и Палестине.

В русском контексте фамилия Магазинер — редкий случай, когда профессиональное прозвище не русифицировалось, а осталось в исходном виде. Это делает её легко узнаваемой и однозначно указывает на занятие предка: он либо торговал, либо заведовал складскими запасами.