Фамилия Магеррамов происходит от мужского имени Магеррам, что является одной из форм арабского имени Мухаррам. В переводе с арабского оно означает «запретный» или «священный». В исламском календаре мухаррам — это название первого месяца лунного года (хиджры). Первые десять дней этого месяца — время траура, особенно у шиитов, которые посвящают их памяти имама Хусейна. Вероятно, предок носителя фамилии родился в один из дней этого священного месяца, и поэтому его нарекли Мухарремом.

Фамилия образована по распространённой в тюркских языках модели: к основе имени добавили суффикс -ов, который в русской традиции указывает на принадлежность («сын Магеррама»). Такая схема типична для азербайджанских, татарских и других фамилий народов, долгое время живших в контакте с русской культурой. Вариант Магеррамов встречается реже, чем Мухаррамов или Мухаремов, что может говорить о региональных особенностях произношения или записи в документах. Фамилия не даёт прямых указаний на сословие: её могли носить и крестьяне, и горожане, и духовные лица — в зависимости от места, где жил человек.