Фамилия Макарушкин — наглядный пример того, как в русской ономастике уменьшительно-ласкательные формы имён превращались в официальные родовые прозвания. В её основе лежит имя Макар (др.-греч. makarios — «блаженный», «счастливый»), а вот суффиксальная цепочка — -ушк-ин — выдаёт народную, бытовую модель образования.

Если фамилии Макаров, Макаркин или Макарычев строятся по стандартным схемам, то Макарушкин — более редкий случай. Суффикс -ушк- в русских фамилиях выполнял две функции: либо указывал на очень маленького, младшего в семье («маленький Макар»), либо, что чаще, служил знаком ласкового, домашнего обращения. В крестьянской среде до отмены крепостного права человека в документах могли записать полным именем, а в быту звали Макарушка. Когда в XIX веке фамилии массово закреплялись за бывшими дворовыми и государственными крестьянами, это прозвище-обращение и легло в основу фамилии Макарушкиных.

Географически фамилия тяготеет к центральным и южнорусским областям, а также к Поволжью — регионам, где имя Макар было особенно распространено. Встречается она заметно реже, чем однокоренные Макаровы, и почти не имеет дворянского следа: это типичная крестьянская или мещанская фамилия, образованная не от официального полного имени, а от того, как человека называли свои же односельчане. Таким образом, Макарушкин буквально означает «сын Макарушки» или «потомок того, кого все звали Макарушкой».