Фамилия Макешина образована от нецерковного имени Макеш, которое восходит к имени древнеславянской богини Мокоши (или Макеши). Это единственное женское божество в пантеоне князя Владимира, чей идол стоял на вершине холма в Киеве рядом с кумирами Перуна, Велеса и других главных богов. Такое соседство говорит о высоком положении Мокоши: она считалась богиней плодородия, покровительницей женских ремесел и домашнего хозяйства.

Имя Макеш — народная, упрощенная форма имени Мокошь. В древнерусском языке чередование «о/а» в корне — обычное явление, поэтому имя богини могли произносить и как Макешь, и как Макеш. Вероятно, так назвали ребенка в языческой семье, желая отдать его под покровительство могущественного божества или подчеркнуть связь с земледельческим культом плодородия.

Образ богини со временем изменился. В народных поверьях Мокош представляли длиннорукой, большеголовой женщиной, которая прядет по ночам в избе. Поверья запрещали оставлять кудель, иначе Мокошь могла отпрясть ее за хозяев. В этом облике древняя богиня женских ремесел слилась с образом святой Параскевы Пятницы. Ей приносили жертву, бросая в колодец пряжу и кудель; обряд называли «мокрида». Само имя Мокошь лингвисты связывают со словами «мокрый», «мокнуть» — вероятно, из-за связи с водой, дождем и плодородием.

Фамилия Макешина образована по стандартной модели: к основе Макеш- добавили суффикс -ин, указывающий на принадлежность. В буквальном смысле Макешина — «дочь или жена Макеша». Такие фамилии на -ин типичны для северных и центральных регионов России, где прозвищные имена были особенно распространены.

Других версий происхождения фамилии, например от профессии или географического названия, не существует. Все варианты сводятся к личному имени Макеш, которое вышло из употребления вместе с крещением Руси, но оставило след в виде фамилии.