Фамилия Макерина — редкий и необычный пример, где окончание -а выдает женскую форму, а значит, исходная мужская фамилия — Макерин. Такое окончание типично для юга России и Украины, где женские фамилии на -а часто сохранялись в официальных документах, или же перед нами форма родительного падежа от прозвища Макеря.

Корень фамилии — имя или прозвище Макер. Самая очевидная версия: это просторечная форма церковного имени Макарий (от греческого «макариос» — блаженный, счастливый). В русских говорах имя Макар сокращали до Макер, а от него образовывали уменьшительное Макеря. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «сын Макери» или «человек из семьи Макери».

Есть и вторая, более редкая версия, связанная с географией. В некоторых говорах «макера» могли называть человека родом с определенной местности или связанного с рекой Макерой (такой топоним встречается в Сибири). Однако это лишь гипотеза, не подкрепленная массовыми данными.

Словообразовательная модель проста: основа Макер (от Макар) плюс суффикс -ин. Фамилия недворянская, скорее всего, крестьянская или мещанская. Встречается в основном в центральных и южных областях России, а также на Украине, где имя Макар было особенно популярно. Носителей этой фамилии немного, что делает ее ценной для генеалогического поиска — предки, скорее всего, жили компактно в одном селе или уезде.