Фамилия Макерская — женская форма, указывающая на происхождение от предка по мужской линии, носившего прозвище или фамилию Макерский. В основе этой фамилии лежит географическая привязка — типичный случай, когда человека называли по месту, откуда он был родом.

Наиболее вероятная версия связывает прозвище Макерский с топонимом Макерово. Это деревня в Вологодской области. Если человек переселялся оттуда, его могли прозвать Макерским — то есть «тем, кто из Макерова». Со временем это прозвище закрепилось за его потомками как фамилия.

Существует и другая, менее распространённая гипотеза. Прозвище могло возникнуть от гидронима Макера — названия левого притока реки Большая Лаба на Северном Кавказе (бассейн Кубани). В таком случае прозвище указывало бы на выходца с берегов этой реки. Однако Вологодская область — более традиционный регион для фамилий на -ский, образованных от названий деревень, поэтому первая версия выглядит убедительнее.

Модель образования типична для дворянских и духовных фамилий XIX века, но встречалась и у крестьян, если те переезжали из одного села в другое. Вологодская основа намекает на севернорусские корни рода.