Фамилия Макерова — женская форма фамилии Макеров, и её происхождение не так очевидно, как у фамилий на -ов от крестильных имён. В основе, скорее всего, лежит прозвище или мирское имя Макер, которое могло возникнуть двумя путями.

Первый и самый вероятный вариант — связь с глаголом «макерить» или «макарить» (в разных говорах означало «делать, мастерить», а также «мошенничать, плутовать»). В таком случае Макером называли либо умельца, «мастера на все руки», либо, наоборот, хитрого и изворотливого человека. Прозвища от глаголов с суффиксом -ер- в русской ономастике редки, но встречаются (ср. Шулеров, Мастеров). Вторая версия — искажённое каноническое имя Макарий (греч. «блаженный»), где конечное -ий в народной речи могло отпасть, а «Макар» перейти в «Макер» под влиянием местного произношения. Однако фамилия Макеров, а не Макаров, указывает, что исходная форма была именно Макер, а не Макар.

Суффикс -ов в мужском варианте (Макеров) — стандартный патронимический, указывающий на принадлежность: «сын Макера». В русской традиции фамилии такого типа закреплялись за детьми по имени или прозвищу отца. Географически фамилия Макеровы встречается спорадически, без ярко выраженного гнезда, что типично для прозвищных фамилий, а не для массовых от имён святых.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Макаров, Макарьев, Макашин) показывает, что Макеров стоит особняком: у него нет параллелей с церковным именем, зато есть созвучие с диалектным словом «макер» — в некоторых говорах так называли торговца маком или просто болтуна. Это добавляет третью, менее весомую, но возможную версию: прозвище по занятию или привычке. В любом случае, предок носительницы фамилии — человек, которого в своей среде называли Макером, и это имя было достаточно ярким, чтобы стать родовым.