Фамилия Махурин — редкий случай, когда за основу взяли не имя и не профессию, а, скорее всего, прозвище с яркой эмоциональной окраской. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Махурин — «сын Махуры» или «человек из семьи Махуры». Сама основа «Махур-» почти наверняка восходит к диалектному слову «махура», которое в разных говорах означало «неряха», «разиня», «неуклюжий человек» или, по другим данным, «плут» и «проныра». В любом случае это прозвище давали не за внешность или место жительства, а за поведение — либо за медлительность и неловкость, либо, наоборот, за хитрость.

Важная деталь: в отличие от фамилий на -ов/-ев, модель на -ин чаще встречается у фамилий, образованных от слов женского рода (ср. Фомин — от Фома, но Махурин — от женского прозвища «Махура»). Это не значит, что предок был женщиной: прозвище на -а могло принадлежать мужчине (вспомните известные прозвища «Молча», «Шуба», «Губа»). Иногда «Махурой» называли человека, который постоянно «махарил» — то есть мошенничал или недобросовестно торговал, что указывает на возможную связь с ремеслом барышника или перекупщика.

Географически фамилия тяготеет к центральным и южнорусским областям, где слово «махура» фиксировалось в говорах. Встречаются также однокоренные фамилии Махуров и Махур, но Махурин — самая характерная по своей модели. В словаре Б. Унбегауна фамилия не упоминается, что подтверждает её локальный и нечастый характер.

Если принять версию с «неуклюжестью», то предок мог быть медлительным работником или крестьянином, которого в шутку прозвали за нерасторопность. Если же версия с «плутовством» — перед нами потомок человека, который в глазах соседей был хитрецом или мелким жуликом. Оба варианта правдоподобны, но первая версия (от «неряха/разиня») встречается в диалектных словарях чаще, поэтому её можно считать основной.