Основой фамилии Макоткин послужило мирское имя Макотка. Фамилия Макоткин образована от сокращенной формы мужского канонического имени Максим – Маконя. Максим в переводе с латинского означает «величайший». Покровителем этого имени является Максим Исповедник – византийский православный богослов и религиозный деятель, причисленный к лику святых. Согласно другой гипотезе, данная фамилия связана с украинским словом «макотиря» - «стриженная или лысая голова». В этом случае фамилия может указывать на определенные особенности внешнего облика предка ее обладателя. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Макотка, со временем получил фамилию Макоткин. Фамилия Макоткин восходит к нарицательному «мак». Возможно, Макоткой называли умного, башковитого человека (от слова «маковка» - «макушка головы»). Однако такое прозвище могли дать и тому, кто продавал пироги с маком или сеял мак. Нельзя исключить и связь фамилии со словом «макотра» - «большой, широкий горшок, в котором трут кием мак, табак». Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Макотка, со временем получил фамилию Макоткин.