Фамилия Мякоткин образована от прозвища Мякотка, и у этого прозвища, судя по всему, было несколько разных источников. Самая конкретная версия связывает его с диалектным словом «мякота»: в самарских и саратовских говорах так называли паханую землю, поле, с которого уже снят один хлеб. Тогда Мякоткой могли прозвать крестьянина, владевшего таким мякотным полем. Но тут же возникает и вторая, «профессиональная» линия: не исключено, что основатель рода занимался выделкой кож, и прозвище как-то отражало эту работу.

Есть и более простое объяснение — от прилагательного «мягкий», то есть прозвище могло характеризовать характер человека, его уступчивость или доброту. Спорить, какая версия вернее, сложно: все три имеют право на существование, и без знания конкретной семейной истории выбрать одну невозможно. Но важно, что прозвище Мякотка действительно бытовало в старину. Об этом говорят письменные источники, которые приводит историк С. Веселовский: Мякота Иван Прасолов упоминается в 1500 году в Новгороде, а в 1564 году в Обонежской пятине встречаются Мякотовы-своеземцы. Позже, в 1625 году, в Зарайске жил посадский человек Григорий Мякотин.

Обратите внимание на суффикс: прозвище Мякотка звучит ласкательно, с уменьшительным оттенком, и это типично для неофициальных именований простых людей того времени. А фамилия Мякоткин закрепилась за потомками такого человека по стандартной модели: к основе на -а добавили притяжательный суффикс -ин, что буквально означает «чей-то» — сын Мякотки. Кстати, однокоренные фамилии Мякотин и Мякотов встречаются в истории не реже, так что род Мякоткиных — лишь одна из ветвей этого разветвлённого семейного древа.