Фамилия Мякотин образована от личного прозвища и относится к распространенному типу русских фамилий. Прозвище Мякота восходит к аналогичному нарицательному: так в самарских и саратовских говорах называли паханую землю, поле, с которого снят один хлеб. Следовательно, Мякотой могли называть и крестьянина, имевшего мякотное поле. В таком случае прозвище Мякота могло относиться к числу «профессиональных» именований и указывать на род занятий человека: не исключено, что основатель рода Мякотиных занимался выделкой кож. Наконец, прозвище Мякота могло быть образовано и от слова «мягкий». Веселовского упоминаются: Мякота Иван Прасолов, 1500 г., Новгород; Мякотовы, своеземцы, 1564 г., Обонежская пятина; Григорий Мякотин, посадский человек, 1625 г., Зарайск. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Мякота, со временем получил фамилию Мякотин. О точном месте и времени возникновения фамилии Мякотин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Мякотин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.