Фамилия Макрушан — редкий пример восточнославянской фамилии с молдавским или румынским суффиксом. Её основа — прилагательное «макруш» — южнославянский или румынский вариант слова «мокрый». В румынском и молдавском языках «macruş» означает «сырой», «влажный», «промозглый». Формант -ан типичен для фамилий, образованных на территории Бессарабии, Буковины и Молдавии: он присоединялся к прозвищам, указывая на принадлежность к роду или месту (ср. Бурдужан, Кожокарь-Кожокарян). Таким образом, Макрушан — это «потомок того, кого прозвали Макруш», то есть человека, жившего в сырой низине, у болота или просто обладавшего влажным, «мокрым» характером (например, плаксивого или бледного).

Словообразовательная модель проста: корень макр- (от общеславянского *mokrъ, с переходом о→а под южным или румынским влиянием) + суффикс -уш (уменьшительно-уничижительный) + фамильный суффикс -ан. В украинской и польской традиции такой суффикс встречается реже, чем в молдавской, поэтому география фамилии сужается до Черновицкой, Одесской областей Украины и прилегающих районов Молдавии. В России Макрушаны — единичные семьи, потомки переселенцев конца XIX — начала XX века.

Родственные фамилии — Макрушин (русский вариант с суффиксом -ин), Макруш (без суффикса), а также Макруха, Макруша. Связь с молдавским языком подтверждается тем, что в румынских говорах слово «macruş» зафиксировано именно как прозвище — для человека с бледной, «мокрой» кожей или живущего у воды.

Сословного барьера фамилия не имела: её могли носить и крестьяне, и мещане. В документах XIX века Макрушаны встречаются среди православных жителей Хотинского и Сорокского уездов Бессарабской губернии — в основном как земледельцы или рыбаки. Ударение, скорее всего, падает на последний слог — Макрушан, что тоже указывает на южное происхождение.