Фамилия Малехотко сразу привлекает внимание необычным сочетанием звуков и редким суффиксом -к-о. Это типичная фамилия украинского происхождения, образованная по модели, характерной для западных регионов Украины — Волыни, Галичины, Подолья. Суффикс -к-о в украинской ономастике — уменьшительно-ласкательный, он присоединялся к основе личного имени или прозвища и закреплялся как фамилия. В русской традиции такие фамилии часто «обрусевали», меняя окончание на -ков (Малехотков), но исходная форма Малехотко сохранилась у носителей, чьи предки не покидали украинскую языковую среду.

Основа фамилии — «Малехот» или «Малехота». Скорее всего, это производное от крестильного имени Малахия (древнееврейское «посланник Бога») или его народной формы Малах, Малаха. В украинском языке имя Малахия трансформировалось в Малахій, а в бытовой речи — в Малеха, Малехо. Суффикс -от- (как в «хохот», «топот») в прозвищах встречается редко и придаёт основе оттенок действия или свойства: Малехота могло означать «тот, кто похож на Малеха» или «сын Малеха». Менее вероятная, но возможная версия — связь с польским «mały» (маленький) или диалектным «малеха» (мелкая рыба, малёк), но тогда фамилия звучала бы скорее как Малешко или Маленко.

География фамилии подтверждает украинские корни. Основная масса носителей Малехотко встречается в Хмельницкой, Винницкой и Житомирской областях, а также среди потомков переселенцев в Сибири и на Дальнем Востоке. В ревизских сказках XIX века фамилия фиксируется в основном среди крестьян и казаков, что неудивительно: в среде мещан и дворян такие «простые» суффиксальные формы были редкостью.

Словообразовательная модель Малехотко интересна тем, что в ней сочетаются два суффикса: сначала -от- (или -хот-), а затем -к-о. Это не типичная конструкция: обычно украинские фамилии на -ко образуются от односложных основ (Иван → Иванко, Гриць → Грицько). Здесь же основа наращена, что говорит о вторичном образовании: сперва возникло прозвище Малехота, а уже от него — фамилия Малехотко. Такая двойная суффиксация — редкая деталь, которая позволяет отличить фамилию от более частых Малеев, Малец или Малых.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Малехотко стоит в одном ряду с Малех, Малехов, Малехин, но сдвинуто в сторону уменьшительной модели. В польских записях встречается форма Malechotko, что указывает на возможное влияние католической традиции записи имени Малахия как Malachiasz. В целом, фамилия Малехотко — редкий пример украинской фамилии с нестандартной суффиксацией, сохранившейся без русификации, что делает её ценной для изучения народной ономастики Правобережной Украины.