Фамилия Малихатка — редкая и неоднозначная. Её основа, «Малихат» или «Малихатка», почти наверняка не славянского происхождения, а восходит к арабскому или тюркскому женскому имени Малиха (Маликат). В арабском языке «Малиха» означает «красивая», «приятная», «грациозная», а также может быть формой имени Малика («царица», «владычица»). Форма «Малихатка» — это, скорее всего, уже русифицированный вариант, где к основе добавился суффикс -к(а), характерный для украинских и южнорусских говоров при образовании прозвищ или фамилий от женских имён.

Словообразовательная модель здесь нетипична для русских фамилий: суффикс -ов/-ев или -ин отсутствует. Фамилия застыла в форме притяжательного или ласкательного прозвища. Это могло означать, что предок был сыном или человеком, связанным с женщиной по имени Малиха (например, «Малихатка» — «тот, кто у Малихи», или «маленькая Малиха»). В среде казачества или переселенцев юга России и Украины такие фамилии от женских имён встречаются чаще, чем в центральных областях.

Географически фамилия Малихатка встречается в основном на юге России, в частности в Ростовской области, Краснодарском крае и на Украине (Харьковская, Днепропетровская области). Это указывает на регион, где смешивались славянские и тюркские влияния. Вторая возможная, но менее вероятная версия — связь с диалектным словом «малиха» (от «малый»), которое могло означать «небольшой, невысокий человек». Однако это предположение слабо подкреплено данными, так как слово «малиха» в значении «маленький» не зафиксировано в словарях как распространённое прозвище.

Таким образом, наиболее правдоподобно, что фамилия Малихатка — это русифицированная форма от женского восточного имени, закрепившаяся в казачьей или крестьянской среде юга России. Носители фамилии, скорее всего, потомки людей, живших в смешанных этнических регионах, где арабские и тюркские имена были привычны.