Основой фамилии Мальнова послужило мирское имя Мальный. Мирское имя Мальный берет начало от аналогичного прилагательного, которое в ряде говоров имеет значение «малый», «небольшой по возрасту». Вероятно, родители назвали именем Мальный младшего ребенка в семье. При этом возможно и то, что имя Мальный имело обрядовый характер. К подобным именованиям может относиться и именование Мальный. Не исключено, что фамилия Мальнова образована от прозвища Мальный, восходящего к аналогичному прилагательному со значением «низкорослый, невысокий». Скорее всего, именование Мальный отражает особенности внешности его обладателя. Так могли назвать того, кто был небольшого роста. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Мальный, со временем получил фамилию Мальнов.